MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC2

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007487	G	6	6	15	20	0 %	0 %	100 %	0 %	77404589
2	NC_007487	CGA	2	6	77	82	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404589
3	NC_007487	CGA	2	6	117	122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404589
4	NC_007487	CGC	2	6	201	206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404589
5	NC_007487	GC	3	6	210	215	0 %	0 %	50 %	50 %	77404589
6	NC_007487	CA	3	6	278	283	50 %	0 %	0 %	50 %	77404589
7	NC_007487	TGG	2	6	289	294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404589
8	NC_007487	CGG	2	6	387	392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404589
9	NC_007487	CGGCC	2	10	456	465	0 %	0 %	40 %	60 %	77404589
10	NC_007487	CCA	2	6	491	496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404589
11	NC_007487	CA	3	6	499	504	50 %	0 %	0 %	50 %	77404589
12	NC_007487	TGGGCC	2	12	539	550	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404589
13	NC_007487	GTG	2	6	597	602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404589
14	NC_007487	ACC	2	6	635	640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404589
15	NC_007487	GCA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404589
16	NC_007487	GAA	2	6	754	759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404589
17	NC_007487	GGC	2	6	796	801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404589
18	NC_007487	AAG	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404589
19	NC_007487	ACG	2	6	854	859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404589
20	NC_007487	GCA	4	12	927	938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404590
21	NC_007487	TCG	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404590
22	NC_007487	ACG	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404590
23	NC_007487	CCGG	2	8	1196	1203	0 %	0 %	50 %	50 %	77404591
24	NC_007487	CCGG	2	8	1219	1226	0 %	0 %	50 %	50 %	77404591
25	NC_007487	CCG	2	6	1262	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404591
26	NC_007487	GAT	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404591
27	NC_007487	GCC	2	6	1363	1368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404591
28	NC_007487	GGC	2	6	1436	1441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404591
29	NC_007487	CGGG	2	8	1460	1467	0 %	0 %	75 %	25 %	77404591
30	NC_007487	AGC	2	6	1576	1581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404591
31	NC_007487	CAC	2	6	1838	1843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007487	GGA	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007487	GCC	2	6	1888	1893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007487	GCA	2	6	1900	1905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007487	TGGGGG	2	12	1925	1936	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007487	GCC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007487	TG	3	6	1965	1970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007487	CGGAAA	2	12	1992	2003	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007487	CG	3	6	2041	2046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007487	TCGGCG	2	12	2105	2116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007487	AGA	2	6	2186	2191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007487	GT	3	6	2228	2233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007487	TTC	2	6	2254	2259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007487	GAC	2	6	2271	2276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007487	TGG	2	6	2341	2346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007487	AGCA	2	8	2451	2458	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007487	GC	3	6	2539	2544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007487	GT	3	6	2568	2573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007487	ACG	2	6	2644	2649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007487	CCG	2	6	2654	2659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007487	CGT	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007487	CAGCG	2	10	2713	2722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_007487	CCG	3	9	2792	2800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007487	CTC	2	6	2803	2808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007487	TCGC	2	8	2813	2820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007487	CCCG	2	8	2824	2831	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_007487	CAC	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007487	CCG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007487	CA	3	6	2983	2988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007487	CGG	2	6	3020	3025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007487	CCA	2	6	3029	3034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007487	CAC	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007487	CACCCT	2	12	3050	3061	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007487	AC	3	6	3070	3075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007487	TCC	2	6	3093	3098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_007487	ACC	2	6	3115	3120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007487	ACGC	2	8	3121	3128	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007487	CGGC	2	8	3146	3153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007487	CGGC	2	8	3162	3169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007487	CGGC	2	8	3178	3185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007487	CGGC	2	8	3194	3201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007487	CGGC	2	8	3210	3217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007487	CGGC	2	8	3226	3233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007487	CGGC	2	8	3242	3249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007487	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007487	AAC	2	6	3276	3281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007487	GC	3	6	3303	3308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007487	ACCT	2	8	3317	3324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007487	AGC	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007487	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007487	CACC	2	8	3363	3370	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_007487	AGA	2	6	3460	3465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007487	TGG	2	6	3507	3512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007487	GGA	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007487	AAT	2	6	3571	3576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007487	GGGC	2	8	3619	3626	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.